馬家祠堂在風水上是有一定講究的，從選址來看，一般要求背山面水、明堂寬大，有“左環右抱必有氣”的理想環境模式，方位多坐北朝南或坐西朝東等，其建筑布局也遵循風水原則，如前庭要寬敞明亮以吸納陽氣，正堂莊重肅穆用于祭祀祖先，后堂溫馨舒適方便家族聚會。

一、選址講究

馬家祠堂選址注重龍脈和生氣來源，力求背山面水，這樣的格局在風水上被認為是能藏風聚氣，有利于宗族的興旺，而且對周邊環境也有要求，比如四周群峰屏列，前有門戶把守，后有靠山依托，山水相依，仿佛是一個天然的庇護所，為祠堂營造出一種祥瑞的氛圍。

二、方位與布局

在方位上，除了常見的坐北朝南、坐西朝東，還會根據特殊龍脈條件靈活選擇，其建筑組織和布局有規制，規模大小雖各有不同，但整體要體現出方正、穩重的特點，前庭、正堂、后堂的布局合理，前庭納陽，正堂敬祖，后堂聚人，各部分功能明確，相互配合。

三、周邊建筑的影響

在祠堂周邊建房也有諸多講究，房子不能建得比祠堂高，要以表示對先人的尊敬，而且房子要方正不缺角，避免出現破財等不利情況，也不能破壞祠堂原來的格局，最好能與祠堂的整體布局相協調。

這些風水講究到底對馬家祠堂以及馬氏宗族有著怎樣實際的影響呢？是心理層面的慰藉，還是真的能對家族的發展產生作用呢？這是一個值得深入探究的問題。